Hän syntyi 27.11.1947 Dire Dawassa Etiopiassa. Hän muutti Djiboutiin saamatta käytyä loppuun lukiota. Kun Djibouti itsenäistyi hänestä tuli salaisen poliisin päällikkö. Hän sai koulutusta mm. Somalian kansalliselta turvallisuuspalvelulta ja Ranskan salaiselta palvelulta.

Guellah voitti perisentinvaalit huhtikuussa 1999 75% äänimäärällä ja hän otti viran vastaan 8.5.1999.

Vuoden 2005 presidentinvaaleissa on oli ainoa ehdokas ja hänet valittiin toiselle virkakaudelle. Tällöin Guelleh ilmoitti, että tämä on hänen viimeinen virkakautensa presidenttinä.